Fundamentalmente, la comunidad del Seminario Menor tiene tres misiones fundamentales:
- Ayudar a los que manifiestan indicios de vocación sacerdotal a que hagan un serio discernimiento.
- Dar a estos chicos todos los medios necesarios para su maduración humana y cristiana.
- Acompañar jóvenes idóneos para su entrada en la etapa propedéutica del Seminario.